今年9月初，方舟子在微博中称“要创造条件让国人都吃转基因”，此举让崔永元反感，并引发持续至今的“崔方大战”。其间，崔永元3次自费赴日美调查转基因问题，并加速他最终离职央视。崔永元直言在转基因这个“大是大非”问题上，哪怕螳臂当车，也要说该说的话，不然对不起自己的良心。并且，在这一问题上，崔永元放弃了一些企业的赞助，完全自费50万元到美国开展此项调查。(12月22日《新京报》)
崔永元离开央视的传闻，最终变成了现实。对于观众而言，在电视荧屏上，我们或许再也见不到那位温声细语、语速平缓，却经常性制造爆炸笑料、诙谐中又不乏智慧的主持人了。同时，崔永元的离开以及几年前《实话实说》节目的终结，也很像是一种现实隐喻–专家也好，主持人也罢，能够有立场的实话实说者越来越少了。
在转基因食品问题上，仁见见其仁，智者见其知。认同者如方舟子者可能会认为，转基因能够实现农产品品种的更新以及产量的成倍增长，而反对转基因食品的人如崔永元者，则会认为转基因食品拥有太多的不成熟性和不确定性。而两者的掐架，也终于导致了崔永元的离职。为了能够掌握到反驳这位打着科学主义大旗科学家方舟子的证据，崔永元开始了一个人的努力。笔者认为，这并不是个人恩怨之争，而是像崔永元所说，这是“大是大非“之争，很可能关系到公共健康和公共利益，因此，必须要有个结论。
离职央视也好，自费赴美国搞调研也罢，都让世人看到了一个真正的公知形象。崔永元离开了自己的岗位，并且，拒绝了一些有机食品企业的赞助，还拒绝了一些花钱想让其闭嘴的企业，这一些，在这个物欲横流的时代里，都值得称赞。金钱不会让他说他认为不正确的话，金钱也不能让他失去自己的立场。崔永元说“在转基因这个问题上，哪怕螳臂当车，也要说该说的话，不然对不起自己的良心”。这句话，慷慨激昂、豪情万丈，让人肃然起敬、五体投地。
崔永元不是专家，但是他的这种认真搞研究、找证据的态度，却远远胜过无数所谓专家学者;崔永元，是一位体制内的人，却在谋求在体制之内发出最合理最正确的声音。甚至于为了能够和方舟子公开论战，离开自己喜欢的岗位。崔永元做了太多一名知识分子、一位文人所应该做的事。
崔永元离开央视，其实是一种坚守。正如崔永元“宴请农民工”一样，他的有一些行动和行为的实际意义，已经远远超越这事情本身，它带给了社会以无穷的正能量。它的实验主义，否定了无数看似合理实则荒谬的经验主义;它在“大是大非”上坚守公共立场的态度，也让那些为既得利益者代言的人原形毕露。转基因食品的争论，或是一直会存在。但是，别人对崔永元与方舟子评价，却可能会有“泾渭分明”的效果和差距。(来源：中国网)
