9月28日安省新增700起确诊新冠病例(Covid-19)，这是自一月底疫情在该省开始以来的最高纪录，比八月底时多四倍。上一次的日增Covid-19病例最高纪录是640起，发生在4月24日。但和那时不同的是，现在的感染者当中有60%的年龄在40岁以下。省长Doug Ford在新闻发布会上表示，这一天的病例数字非常令人担忧。“我们知道我们已经身处第二波疫情，我们知道这一波疫情比上一波严重。但我们不知道的是，它会严重到什么程度。”他表示，第二波疫情形势更严峻，情况更复杂。
根据多伦多大学、安省大学卫生网络和Sunnybrook Hospital研究人员联合作出的一项模拟预测，安省第二波疫情高峰将在十月中下旬到来。如果公共卫生部门不推出更严格的抗疫措施的话，日增病例将在十月中旬以前超过一千。研究小组根据不同情况作出四种预测。最好的结果和安大略省三、四月份的第一波疫情类似。当时安省在停工停课后日增病例迅速减少。最坏的结果类似于疫情刚开始时的意大利，重症患者数量将超过重症监护室的床位数量。这种情况在其他三种预测中都可以避免，但研究小组成员Dr. Kali Barrett在接受采访时说，只有在最好的预测结果出现时，其他手术才不会被新冠肺炎救治挤掉。例如高危癌症手术，如果ICU挤满新冠患者，就必须往后推。
目前安省新增的新冠患者中有三分之二的年龄在40岁以下。他们当中将有多少人需要住进ICU是一个不容易预测的变量。但是Dr. Kali Barrett说，西班牙和法国的第二波疫情也是从年轻人当中开始的，但是现在已经蔓延到老年人当中。“这只是个时间问题。我们已经开始看到安大略省正在发生同样的事。“安省卫生部数据显示，70岁以上的新冠患者在一星期里增加了34%。Doug Ford在新闻发布会上向省民发出呼吁。他说，目前的情况非常紧急，未来疫情如何发展，取决于每一个安省居民是否用自己的行动加入抗疫努力。公共卫生部门一再呼吁公众少出门，避免聚会，戴口罩，勤洗手并接种流感疫苗。
而在9月27日，邻省魁北克省新增病例896起，接近今年春季第一波疫情最烈时的水平。9月28日该省再增750起病例，虽然少于前一天，但省政府仍然决定自9月31日起把蒙特利尔、魁北克城和Chaudière-Appalaches三个地区的预警级别从橙黄转为最高级别的红色。这三个地区的预警级别在不到两个星期的时间里从最低的绿色迅速升为最高级。从绿转黄的9月15日，该省日增病例仅292起。在三个红色预警地区，餐馆和酒吧将只能提供外卖服务，影剧院关闭，但其他商家将照常开放。室内聚会仅限于家庭成员，室外聚会不超过25人。
一个地区的疫情预警级别取决于日增病例数量、检测阳性率、病毒再生率以及当地医疗系统所受到的压力。红色预警级别的日增病例为平均每10万人10起以上，检测阳性率为5%以上(即每检测一百人有五个以上阳性结果)，病毒再生率为一名患者感染6人以上。魁北克省长François Legault在9月28日特意把新闻发布会改在下午5点半举行，目的是让更多的省民看到。这是他在接受预防性十天隔离后第一次露面。在这一天天新增的750起病例中，245起在蒙特利尔地区，125起在魁北克城地区。与第一波疫情不同的是，上一次在这两个地区之外病例很少，但这一波疫情在其他地区出现了多个规模较小的社区感染。
